体質を変化させることで花粉症を根本から改善する方法として、従来は皮下免疫療法という方法が行われていました。これは皮膚にアレルギーの原因物質（アレルゲン）を少しずつ口内の粘膜の投与することで、徐々に体をアレルゲンに慣れさせるものです。しかし、十分な効果が得られるまでに2～5年程度かかるため、敷居の高い方法であったとも言えます。
一方、舌下免疫療法は皮下免疫療法のような皮下注射ではなく、治療薬を舌の下に滴下し、2分間保持した後に飲み込むものなので、痛みなどの負担はありません。また、皮下免疫療法よりも副作用が少ないとされています。舌下免疫療法は2014年10月より保険適用となっており、治療を受けられた方のうち約60％の方で症状の改善が期待できます。
ただし、舌下免疫療法はダニとスギ花粉の花粉症に対しての治療方法であるため、他のアレルゲンが原因の場合は十分な効果が期待できないと言えます。また、症状が重篤な方や、複数のアレルギー症状を持つ場合も十分な効果が期待できないと言えます。

舌下免疫療法は最低でも3年程度は継続しなければいけませんが、治療を開始して2～3ヶ月程度で効果が実感できる場合があります。また、治療開始直後と花粉飛散シーズンに副作用が出やすくなりますので、スギ花粉の飛散時期が過ぎた6月から12月までが新規治療に最適な時期となります。なお、早期に治療を開始した方が翌年のスギ花粉による花粉症の症状が抑えられる可能性が高まりますので、できるだけお早目にご相談されることをおすすめします。